Details for gene set V$AP3

Table: GSEA Results Summary

Dataset	RNR_GSEA_DESEQ2_FC
Phenotype	NoPhenotypeAvailable
Upregulated in class	na_pos
GeneSet	V$AP3_Q6
Enrichment Score (ES)	0.16402969
Normalized Enrichment Score (NES)	2.951234
Nominal p-value	0.0
FDR q-value	1.1244569E-4
FWER p-Value	0.001

Table: GSEA details [plain text format]
	PROBE	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	CACNG2	152	1.815	-0.0040	Yes
2	HAPLN1	238	1.383	-0.0043	Yes
3	TBC1D21	259	1.315	-0.0011	Yes
4	NRN1L	345	1.112	-0.0015	Yes
5	LEMD1	372	1.060	0.0014	Yes
6	ASCL3	491	0.914	-0.0008	Yes
7	MGAT4C	588	0.780	-0.0017	Yes
8	HOXB6	777	0.623	-0.0077	Yes
9	MASP1	792	0.619	-0.0042	Yes
10	GLRA2	898	0.570	-0.0056	Yes
11	FOXP2	943	0.550	-0.0037	Yes
12	NRXN3	955	0.545	-0.0000	Yes
13	IRX2	1067	0.494	-0.0018	Yes
14	SULF1	1190	0.441	-0.0041	Yes
15	UPK2	1240	0.427	-0.0025	Yes
16	CNBD1	1273	0.416	-0.0000	Yes
17	SP6	1436	0.359	-0.0045	Yes
18	CGN	1558	0.338	-0.0068	Yes
19	BAI3	1633	0.322	-0.0066	Yes
20	PCDH9	1665	0.317	-0.0040	Yes
21	OTX2	1672	0.316	-0.0001	Yes
22	SPRY4	1728	0.307	0.0012	Yes
23	SLC44A1	1832	0.287	-0.0001	Yes
24	MYOCD	1883	0.279	0.0015	Yes
25	ARID5A	1951	0.267	0.0021	Yes
26	UNC5C	1991	0.263	0.0042	Yes
27	PCDHA6	2000	0.262	0.0081	Yes
28	ELAVL2	2066	0.255	0.0088	Yes
29	PAPPA	2174	0.242	0.0073	Yes
30	RORA	2270	0.231	0.0064	Yes
31	DMD	2280	0.230	0.0102	Yes
32	DDX6	2302	0.228	0.0133	Yes
33	COL4A4	2328	0.226	0.0162	Yes
34	ATP6V1E2	2337	0.225	0.0201	Yes
35	PRDM12	2427	0.215	0.0195	Yes
36	SERPINB12	2434	0.215	0.0234	Yes
37	PHF3	2435	0.215	0.0277	Yes
38	ETV1	2511	0.210	0.0279	Yes
39	JMJD1C	2530	0.208	0.0312	Yes
40	GAS2	2539	0.207	0.0350	Yes
41	FSTL1	2608	0.201	0.0356	Yes
42	CHD6	2624	0.200	0.0391	Yes
43	PHF17	2698	0.193	0.0394	Yes
44	C18orf54	2721	0.192	0.0425	Yes
45	ANKRD7	2765	0.188	0.0444	Yes
46	ARHGAP11A	2800	0.185	0.0468	Yes
47	NPC2	2808	0.185	0.0507	Yes
48	MLLT10	2818	0.184	0.0545	Yes
49	ERN1	2870	0.181	0.0560	Yes
50	NEO1	2876	0.180	0.0600	Yes
51	PPM1E	2888	0.179	0.0637	Yes
52	CDK14	2899	0.179	0.0674	Yes
53	AHR	3000	0.173	0.0663	Yes
54	SREK1	3026	0.171	0.0692	Yes
55	PCDHGB2	3046	0.169	0.0724	Yes
56	MPV17	3078	0.168	0.0750	Yes
57	SAV1	3084	0.168	0.0790	Yes
58	PDE3B	3088	0.167	0.0831	Yes
59	PLAG1	3131	0.165	0.0851	Yes
60	TRPM1	3150	0.163	0.0884	Yes
61	MAP4K4	3184	0.160	0.0909	Yes
62	TAL1	3202	0.160	0.0942	Yes
63	HIVEP1	3211	0.159	0.0981	Yes
64	COL4A3	3265	0.157	0.0995	Yes
65	TCEB3B	3289	0.156	0.1025	Yes
66	RBM24	3297	0.155	0.1064	Yes
67	ZFPM2	3318	0.154	0.1096	Yes
68	FN1	3449	0.148	0.1068	Yes
69	TRPS1	3468	0.147	0.1101	Yes
70	SOBP	3546	0.143	0.1101	Yes
71	WHSC1L1	3616	0.139	0.1107	Yes
72	FGF13	3624	0.139	0.1146	Yes
73	NUP155	3717	0.135	0.1138	Yes
74	TBX19	3806	0.130	0.1133	Yes
75	ARHGAP21	3877	0.127	0.1138	Yes
76	CRK	4017	0.122	0.1105	Yes
77	TSPAN16	4037	0.121	0.1138	Yes
78	CCDC91	4061	0.120	0.1168	Yes
79	NCKAP5	4100	0.118	0.1190	Yes
80	PID1	4114	0.118	0.1226	Yes
81	ABHD1	4131	0.117	0.1260	Yes
82	CASK	4140	0.117	0.1298	Yes
83	CD109	4201	0.115	0.1308	Yes
84	RBM11	4447	0.107	0.1218	Yes
85	KCNK5	4488	0.105	0.1239	Yes
86	SPARC	4769	0.095	0.1129	Yes
87	CALD1	4845	0.093	0.1131	Yes
88	SMAD1	4924	0.091	0.1131	Yes
89	NCKIPSD	4929	0.091	0.1172	Yes
90	ARHGAP12	5076	0.087	0.1135	Yes
91	CHD2	5153	0.085	0.1137	Yes
92	RPS6KB1	5181	0.084	0.1165	Yes
93	SGMS2	5251	0.082	0.1170	Yes
94	SRSF1	5422	0.078	0.1120	Yes
95	TAF15	5456	0.077	0.1145	Yes
96	TTLL3	5555	0.074	0.1135	Yes
97	NRP1	5567	0.073	0.1171	Yes
98	PRDM2	5628	0.072	0.1182	Yes
99	NSD1	5655	0.071	0.1210	Yes
100	ARHGAP17	5728	0.069	0.1214	Yes
101	RADIL	5770	0.068	0.1234	Yes
102	ATP13A4	5826	0.067	0.1247	Yes
103	DFNB31	5841	0.066	0.1282	Yes
104	HNRNPA0	5866	0.066	0.1312	Yes
105	SMPX	5953	0.063	0.1308	Yes
106	GEN1	5970	0.063	0.1342	Yes
107	KCNJ13	6032	0.061	0.1351	Yes
108	EDNRA	6041	0.061	0.1390	Yes
109	SMC6	6099	0.060	0.1402	Yes
110	ACTN4	6106	0.060	0.1441	Yes
111	ERBB4	6124	0.059	0.1475	Yes
112	MBNL1	6126	0.059	0.1517	Yes
113	CTNND1	6190	0.058	0.1525	Yes
114	SEPT5	6401	0.053	0.1454	Yes
115	ESCO1	6537	0.050	0.1423	Yes
116	ANXA6	6547	0.049	0.1461	Yes
117	SMOX	6555	0.049	0.1500	Yes
118	USP32	6676	0.047	0.1477	Yes
119	UBE2V1	6727	0.045	0.1493	Yes
120	MSR1	6777	0.044	0.1509	Yes
121	TNIP1	6897	0.042	0.1487	Yes
122	PATL1	6925	0.041	0.1515	Yes
123	NMT2	6969	0.040	0.1535	Yes
124	LRRN1	6991	0.040	0.1566	Yes
125	JARID2	7034	0.039	0.1586	Yes
126	PRMT10	7081	0.038	0.1604	Yes
127	OTUD7B	7339	0.032	0.1507	Yes
128	MPP6	7391	0.031	0.1522	Yes
129	PICALM	7440	0.030	0.1538	Yes
130	MEIS2	7582	0.027	0.1504	Yes
131	GSTA4	7591	0.027	0.1543	Yes
132	GAN	7649	0.026	0.1554	Yes
133	TBL1XR1	7655	0.026	0.1595	Yes
134	MXD4	7663	0.026	0.1633	Yes
135	SNX6	7730	0.024	0.1640	Yes
136	HDLBP	7835	0.022	0.1627	No
137	SRSF6	8044	0.018	0.1556	No
138	PSMA1	8155	0.016	0.1539	No
139	HMGN3	8310	0.013	0.1498	No
140	OXNAD1	8425	0.011	0.1479	No
141	TMEM59	8664	0.006	0.1392	No
142	RALBP1	8721	0.005	0.1405	No
143	CPNE1	8730	0.004	0.1443	No
144	DPF2	9034	-0.002	0.1321	No
145	TRA2A	9040	-0.002	0.1361	No
146	LRRC57	9373	-0.008	0.1223	No
147	FGF17	9431	-0.009	0.1235	No
148	ENPEP	9458	-0.010	0.1264	No
149	POLD4	9627	-0.014	0.1215	No
150	BAG3	9697	-0.015	0.1220	No
151	TBK1	9699	-0.015	0.1262	No
152	TESK2	9957	-0.020	0.1166	No
153	TCEANC2	9974	-0.020	0.1200	No
154	HOXB7	10002	-0.020	0.1228	No
155	ISCA2	10278	-0.026	0.1121	No
156	DTNA	10405	-0.028	0.1095	No
157	FLI1	10433	-0.028	0.1123	No
158	TRIM54	10526	-0.030	0.1116	No
159	NXF1	10540	-0.031	0.1152	No
160	MYLK	10604	-0.032	0.1160	No
161	GSR	10821	-0.037	0.1085	No
162	TMEFF2	10989	-0.041	0.1037	No
163	WWP2	11037	-0.042	0.1055	No
164	FAM63A	11043	-0.043	0.1095	No
165	RGS6	11061	-0.043	0.1128	No
166	MFAP2	11100	-0.044	0.1150	No
167	SEMA6A	11160	-0.045	0.1161	No
168	CXXC4	11216	-0.047	0.1174	No
169	IL1RAPL1	11269	-0.048	0.1188	No
170	BCL2L2	11399	-0.051	0.1161	No
171	JUND	11515	-0.054	0.1141	No
172	TGIF1	11755	-0.059	0.1054	No
173	ABCA12	11784	-0.060	0.1081	No
174	SEPHS2	11838	-0.062	0.1095	No
175	MMAA	11990	-0.065	0.1056	No
176	KRTCAP2	12025	-0.066	0.1080	No
177	MEOX2	12037	-0.066	0.1117	No
178	WBP1	12078	-0.067	0.1138	No
179	EIF4G1	12409	-0.075	0.1001	No
180	DPH3	12470	-0.077	0.1011	No
181	HAUS2	12670	-0.083	0.0946	No
182	PPM1L	13086	-0.095	0.0763	No
183	CXCL14	13160	-0.097	0.0766	No
184	GFI1	13254	-0.100	0.0758	No
185	NTRK3	13453	-0.106	0.0693	No
186	GAD1	13556	-0.110	0.0681	No
187	TMEM35	13658	-0.114	0.0669	No
188	ALKBH6	13798	-0.119	0.0636	No
189	RCOR2	13833	-0.121	0.0660	No
190	RNF19B	13861	-0.122	0.0688	No
191	RAPGEF4	13966	-0.126	0.0674	No
192	EBF2	13975	-0.127	0.0713	No
193	WNT8B	14314	-0.145	0.0572	No
194	LRRN4CL	14319	-0.145	0.0612	No
195	BMP5	14367	-0.147	0.0629	No
196	IRX4	14420	-0.150	0.0644	No
197	LRP1	14566	-0.157	0.0608	No
198	RGS8	14724	-0.165	0.0565	No
199	TTLL6	14778	-0.169	0.0579	No
200	PTGFR	14838	-0.174	0.0590	No
201	VIT	14863	-0.176	0.0619	No
202	WNT3	15003	-0.186	0.0587	No
203	TRIM8	15267	-0.206	0.0486	No
204	SCNN1A	15284	-0.208	0.0520	No
205	VNN2	15457	-0.223	0.0470	No
206	LHX6	15473	-0.225	0.0504	No
207	NTRK2	15546	-0.232	0.0508	No
208	MYBPC1	15924	-0.278	0.0346	No
209	TRIM46	16289	-0.332	0.0191	No
210	ICAM5	16291	-0.332	0.0233	No
211	PCDH8	16569	-0.393	0.0125	No
212	CD79B	16699	-0.427	0.0097	No
213	ABCG5	16792	-0.451	0.0090	No
214	GPR112	16834	-0.464	0.0111	No
215	NMUR2	16900	-0.480	0.0118	No
216	RND1	16957	-0.492	0.0130	No
217	FEZF2	17131	-0.547	0.0079	No
218	SP7	17418	-0.689	-0.0034	No
219	C5orf64	17475	-0.720	-0.0021	No
220	MYH6	17523	-0.747	-0.0004	No
221	LMO1	17604	-0.808	-0.0005	No
222	C3orf27	17606	-0.810	0.0037	No
223	TACR1	17708	-0.891	0.0025	No
224	HOXD10	17904	-1.044	-0.0038	No
225	LHX5	18157	-1.348	-0.0132	No
226	EVX1	18166	-1.379	-0.0094	No
227	ABCG8	18232	-1.468	-0.0087	No
228	BMP10	18236	-1.483	-0.0046	No
229	ADCY8	18343	-1.736	-0.0060	No
230	POU3F4	18403	-1.983	-0.0050	No
231	PHOX2B	18523	-3.145	-0.0072	No
232	HOXC10	18543	-3.638	-0.0039	No
233	CACNG3	18555	-4.160	-0.0003	No
234	TRIML1	18575	-5.830	0.0030	No